卒後臨床研修センターは、2023年6月に新たに設立されました。
設立の主たる目的は、研修医一人ひとりに寄り添い、お互いに助け合いながら、皆さんが社会の信頼にこたえられる立派な医師に成長できるように多方面から指導しサポートすることです。大津赤十字病院が臨床研修指定病院としての質を社会に対して保証するための重要な役割を担う部門です。
現在、当センターには1年次、2年次あわせて およそ30名の初期研修医（臨床研修医）が所属し、センタースタッフが指導医・上級医、現場の医療スタッフなどと密に連携をとりながら、充実した研修環境の維持に努めています。

北は北海道、南は九州まで、津々浦々からたくさんの研修医が、研修を行っています。「大津赤十字病院で研修がしたい」という、やる気と熱意があれば出身大学は関係ありません。滋賀県に縁もゆかりもないのに、ホームページや動画を目にしたことをきっかけに、当院で研修医をして今もスタッフとして活躍している先輩も少なくありません。